【摘要】目的:本研究旨在明确急性骨筋膜室综合征(ACS)关键基因模块及枢纽靶点。方法:将对照组和实验组大鼠趾长屈肌进行转录组测序,通过生物信息学的方法确定差异表达基因(DEGs),利用 DEGs 构建蛋白质互作网络(PPI)和关键基因模块找出 Hub 基因,再对核心基因集进行功能富集分析,最后对 Hub 基因进行验证。结果:通过 5 个正常大鼠和 5 个 ACS 大鼠趾长屈肌的转录组测序,确定了 548 个 DEGs。将 548 个 DEGs 上传到 String 并用Cytoscape 进行分析,挑选 397 个 DEGs 用于构建 PPI。应用分子复合物检测(MCODE)对重要的基因模块进行聚类得到由 27 个基因组成的关键模块,Friends 分析提示 MyD88 在这些基因中具有最重要的地位。通过对 MCODE 鉴定的核心基因集进行富集分析,发现核心基因集高度富集在炎症反应相关的生物学过程(BP)[ 如炎症反应、白细胞迁移的正向调节、对白介素 -1(IL-1) 的反应等 ] 和京都基因与基因组百科全书(KEGG)(如 TNF 信号通路、NF-κB 信号通路等)。结论:ACS 伴随着明显的炎症反应,通过筛选药物抑制髓样分化因子(MyD88)或 Toll 样受体(TLR)/MyD88/ 核因子(NF-κB)信号通路减轻炎症反应可能对 ACS 的治疗具有一定效果,MyD88 也为诊断 ACS提供了一个可能的候选标志物。为 ACS 的发病机制提供新的见解,并为寻找新的诊断和治疗方法提供潜在的分子靶点。
【关键词】急性骨筋膜室综合征;生物信息学;MyD88;TLR/MyD88/NF-κB 信号通路;炎症反应