【摘要】目的:应用生物信息学分析软件预测并分析人多聚腺苷酸结合蛋白 4(PABPC4)和人内质网二硫化物氧化酶 1α(ERO1α)蛋白结构和功能,并结合该课题组前期实验结果分析其与子痫前期的关系,为预防子痫前期不良妊娠结局提供新的诊疗思路。方法:利用 NCBI 数据库、Protparam 软件、DeepTMHMM、SignalP-5.0、Cell-Ploc 等生物信息学预测软件对 PABPC4 和 ERO1α 蛋白理化性质、信号肽、跨膜区、亚细胞定位分析,选取 String 及 IEDB 等在线网站分析 PABPC4 和 ERO1α 的相互作用蛋白及蛋白优势表位预测。结果:PABPC4 蛋白共编码 660 个氨基酸的,相对分子质量为 72 390.64 道尔顿,为不稳定的亲水性蛋白,无跨膜区,无信号肽,亚细胞定位在细胞质、细胞核上,有多种蛋白与之相互作用。ERO1α 蛋白共编码 468 个氨基酸的,相对分子质量为 54 392.66 道尔顿,为不稳定的亲水性蛋白,无跨膜区,有信号肽,亚细胞定位在内质网上,有多种蛋白与之相互作用。结论:生物信息学预测分析 PABPC4 和ERO1α 含有多个磷酸化位点和 B 细胞优势表位,并且结合前期与子痫前期(preeclampsia, PE)的研究,为进一步针对PABPC4 和 ERO1α 研究 PE 设计多肽提供新靶点。
【关键词】PABPC4;ERO1α;生信分析;子痫前期