【摘要】目的：通过转录组测序挖掘三叶青黄酮成分生物合成相关基因。方法：三叶青叶经过 Illumina HiSeq 4000高通量测序，获得转录组数据，通过数据组装、拼接及注释，挖掘三叶青黄酮类物质生物合成的相关基因。结果：5 个三叶青样品获得 111.281Gb 数据，使用 trinity 组装，得到 626 199 个 transcripts，获得 396 496 个 unigenes，将 unigenes 与NR、Swiss-prot、STRING、GO、KEGG、Pfam 这 6 个数据库进行对比分析。分析 KEGG 代谢通路，获得 3 条与黄酮物质合成的代谢通路。黄酮类物质生物合成的相关基因有：黄酮类 31 条，异黄酮类 2 条；黄酮和黄酮醇 3 条。与三叶青黄酮成分合成相关的酶有：查尔酮合成酶（CHS），查尔酮异构酶（CHI），柚皮素 -3- 双加氧酶（F3H）等九种酶。结论：首次基于三叶青转录组测序数据，获得三叶青黄酮类成分生物合成的关键酶基因，为后续三叶青基因功能的研究提供数据支持。

【关键词】三叶青；转录组；黄酮合酶；黄酮生物合成；代谢途径