【摘要】目的:分析 24 例福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)标本 DNA 采用新的改良的超声打断方法得到的结果与原打断方法得到结果的一致性,进一步优化目前福尔马林固定石蜡包埋样本 DNA 超声打断方法。方法:收集广东省人民医院病理科 2023 年 4—5 月进行二代测序检测病例 24 例,建库过程中根据使用的打断方法不同分为两组,1 组采用原DNA 打断方法(打断条件为:稀释后样本转移入配套的 microTUBE AFA Fiber Snap-Cap 打断管),2 组采用改良 DNA打断方法(打断条件为:稀释后样本转移入一次性超声波核酸打断耗材),比较两组实验结果是否一致。结果:两组实验结果得到的插入片段大小均> 150 bp,符合二代测序实验需要,差异无统计学意义(P > 0.05)。结论:在临床实践中,二代测序建库过程中采用新的福尔马林固定石蜡包埋标本 DNA 超声打断方法可以达到原方法的实验效果,且更加经济实惠,从而能降低二代测序实验成本,值得在临床应用。
【关键词】DNA;超声打断;福尔马林固定石蜡包埋;二代测序